Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms