Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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