Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms