Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CRC3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CRC3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CRC3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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