Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms