Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ifitm3Q9CQW9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms