Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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