Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms