Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms