Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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