Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQC3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms