Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpsQ9CQC2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms