Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NepnQ9CQ76 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NepnQ9CQ76 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NepnQ9CQ76 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NepnQ9CQ76 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NepnQ9CQ76 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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NepnQ9CQ76 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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NepnQ9CQ76 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NepnQ9CQ76 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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