Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms