Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc18Q9CQ07 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms