Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Commd4Q9CQ02 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Commd4Q9CQ02 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms