Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms