Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms