Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim26Q99PN3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms