Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms