Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms