Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms