Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk5rap3Q99LM2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5rap3Q99LM2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms