Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnpo2Q99LG2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms