Protein–RNA interactions for Protein: Q99L88

Sntb1, Beta-1-syntrophin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntb1Q99L88 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntb1Q99L88 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntb1Q99L88 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms