Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms