Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TriobpQ99KW3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms