Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgrnQ99KS2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms