Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps4Q99KG7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps4Q99KG7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms