Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms