Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp11Q99K46 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms