Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrabdQ99JY4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms