Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lims1Q99JW4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms