Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ddb2Q99J79 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ddb2Q99J79 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ddb2Q99J79 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ddb2Q99J79 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ddb2Q99J79 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ddb2Q99J79 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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