Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Def8Q99J78 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms