Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim11aQ99J19 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms