Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sntg2Q925E0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg2Q925E0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms