Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csmd1Q923L3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd1Q923L3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd1Q923L3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd1Q923L3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd1Q923L3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd1Q923L3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd1Q923L3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd1Q923L3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd1Q923L3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd1Q923L3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd1Q923L3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd1Q923L3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd1Q923L3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd1Q923L3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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