Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gtpbp3Q923K4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gtpbp3Q923K4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gtpbp3Q923K4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gtpbp3Q923K4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gtpbp3Q923K4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp3Q923K4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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