Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms