Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms