Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TardbpQ921F2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TardbpQ921F2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TardbpQ921F2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TardbpQ921F2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TardbpQ921F2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TardbpQ921F2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TardbpQ921F2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TardbpQ921F2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TardbpQ921F2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TardbpQ921F2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TardbpQ921F2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms