Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EedQ921E6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EedQ921E6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EedQ921E6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EedQ921E6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EedQ921E6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EedQ921E6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EedQ921E6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EedQ921E6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EedQ921E6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EedQ921E6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EedQ921E6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EedQ921E6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EedQ921E6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EedQ921E6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms