Protein–RNA interactions for Protein: Q91YL3

Uckl1, Uridine-cytidine kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uckl1Q91YL3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uckl1Q91YL3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uckl1Q91YL3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms