Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Synpo2Q91YE8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms