Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms