Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csde1Q91W50 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms