Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam3cQ91VU0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam3cQ91VU0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms