Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT4

Cbr4, Carbonyl reductase family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbr4Q91VT4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr4Q91VT4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms