Protein–RNA interactions for Protein: Q91VN4

Chchd6, MICOS complex subunit Mic25, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd6Q91VN4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd6Q91VN4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chchd6Q91VN4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms